xgboost GridSearchCV take too long or does not goes to the next step Announcing the arrival of Valued Associate #679: Cesar Manara Planned maintenance scheduled April 17/18, 2019 at 00:00UTC (8:00pm US/Eastern) 2019 Moderator Election Q&A - Questionnaire 2019 Community Moderator Election ResultsHow does Xgboost learn what are the inputs for missing values?Xgboost (classification problem) feature importance per input not for the modelHow does XGBoost compute the probabilities in predict_proba()?How to train a xgboost model on data that is too big for the memory?In CNN (Convolutional Neural Network), does the combination of previous layer's filters make next layer's filters?What does the limit of xgboost max_depth=1 represent?Does sklearn's gridsearchCV use the same cross validation train/test splits for evaluating each hyperparameter combination?Scaling does not speed up the SVM modelWhat is GridSearchCV doing after it finishes evaluating the performance of parameter combinations that takes so long?What does it mean to take the “average” of two decision trees by 'voting'

Can a zero nonce be safely used with AES-GCM if the key is random and never used again?

Should you tell Jews they are breaking a commandment?

Why does tar appear to skip file contents when output file is /dev/null?

Windows 10: How to Lock (not sleep) laptop on lid close?

Why is "Captain Marvel" translated as male in Portugal?

Notation for two qubit composite product state

Estimate capacitor parameters

Stop battery usage [Ubuntu 18]

Statistical model of ligand substitution

Do we know why communications with Beresheet and NASA were lost during the attempted landing of the Moon lander?

If A makes B more likely then B makes A more likely"

Problem when applying foreach loop

How to politely respond to generic emails requesting a PhD/job in my lab? Without wasting too much time

Why is there no army of Iron-Mans in the MCU?

The following signatures were invalid: EXPKEYSIG 1397BC53640DB551

Why use gamma over alpha radiation?

What to do with post with dry rot?

Unexpected result with right shift after bitwise negation

Can smartphones with the same camera sensor have different image quality?

Geometric mean and geometric standard deviation

Antler Helmet: Can it work?

Active filter with series inductor and resistor - do these exist?

How to rotate it perfectly?

What was the last x86 CPU that did not have the x87 floating-point unit built in?



xgboost GridSearchCV take too long or does not goes to the next step



Announcing the arrival of Valued Associate #679: Cesar Manara
Planned maintenance scheduled April 17/18, 2019 at 00:00UTC (8:00pm US/Eastern)
2019 Moderator Election Q&A - Questionnaire
2019 Community Moderator Election ResultsHow does Xgboost learn what are the inputs for missing values?Xgboost (classification problem) feature importance per input not for the modelHow does XGBoost compute the probabilities in predict_proba()?How to train a xgboost model on data that is too big for the memory?In CNN (Convolutional Neural Network), does the combination of previous layer's filters make next layer's filters?What does the limit of xgboost max_depth=1 represent?Does sklearn's gridsearchCV use the same cross validation train/test splits for evaluating each hyperparameter combination?Scaling does not speed up the SVM modelWhat is GridSearchCV doing after it finishes evaluating the performance of parameter combinations that takes so long?What does it mean to take the “average” of two decision trees by 'voting'










0












$begingroup$


just strange



%%time
xgb = xgb.XGBRegressor(n_estimators=500, learning_rate=0.07, gamma=0, subsample=0.75, colsample_bytree=1,
max_depth=7, tree_method='gpu_exact')


this code takes around Wall time: 866 ms.



but when I do the gridsearchCV it does not goes to the next step

even though I gave only one parameter



 %%time
xgb = XGBClassifier(tree_method='gpu_exact',verbose_eval=True, silence=False)
kfold = StratifiedKFold(n_splits=10, random_state=0)
xgb_param_grid =
'learning_rate': [0.08,0.09],
'random_state': [0],
'max_depth': [8,9],
'n_estimators': [400,500]

xgbGrid = gsRFC = GridSearchCV(xgb,param_grid = xgb_param_grid, cv=5, scoring="neg_mean_squared_error", n_jobs= 10, verbose = 1)
xgbGrid.fit(X,y)
xgb_best = xgbGrid.best_estimator_

for my understanding, this should not take that long.<br/>
it d


does not go to the next step I do not sure this even working or not

it stop with




Fitting 5 folds for each of 8 candidates, totalling 40 fits
[Parallel(n_jobs=10)]: Using backend LokyBackend with 10 concurrent
workers.




data set size is (15035, 22)
am I doing something wrong?









share









$endgroup$
















    0












    $begingroup$


    just strange



    %%time
    xgb = xgb.XGBRegressor(n_estimators=500, learning_rate=0.07, gamma=0, subsample=0.75, colsample_bytree=1,
    max_depth=7, tree_method='gpu_exact')


    this code takes around Wall time: 866 ms.



    but when I do the gridsearchCV it does not goes to the next step

    even though I gave only one parameter



     %%time
    xgb = XGBClassifier(tree_method='gpu_exact',verbose_eval=True, silence=False)
    kfold = StratifiedKFold(n_splits=10, random_state=0)
    xgb_param_grid =
    'learning_rate': [0.08,0.09],
    'random_state': [0],
    'max_depth': [8,9],
    'n_estimators': [400,500]

    xgbGrid = gsRFC = GridSearchCV(xgb,param_grid = xgb_param_grid, cv=5, scoring="neg_mean_squared_error", n_jobs= 10, verbose = 1)
    xgbGrid.fit(X,y)
    xgb_best = xgbGrid.best_estimator_

    for my understanding, this should not take that long.<br/>
    it d


    does not go to the next step I do not sure this even working or not

    it stop with




    Fitting 5 folds for each of 8 candidates, totalling 40 fits
    [Parallel(n_jobs=10)]: Using backend LokyBackend with 10 concurrent
    workers.




    data set size is (15035, 22)
    am I doing something wrong?









    share









    $endgroup$














      0












      0








      0





      $begingroup$


      just strange



      %%time
      xgb = xgb.XGBRegressor(n_estimators=500, learning_rate=0.07, gamma=0, subsample=0.75, colsample_bytree=1,
      max_depth=7, tree_method='gpu_exact')


      this code takes around Wall time: 866 ms.



      but when I do the gridsearchCV it does not goes to the next step

      even though I gave only one parameter



       %%time
      xgb = XGBClassifier(tree_method='gpu_exact',verbose_eval=True, silence=False)
      kfold = StratifiedKFold(n_splits=10, random_state=0)
      xgb_param_grid =
      'learning_rate': [0.08,0.09],
      'random_state': [0],
      'max_depth': [8,9],
      'n_estimators': [400,500]

      xgbGrid = gsRFC = GridSearchCV(xgb,param_grid = xgb_param_grid, cv=5, scoring="neg_mean_squared_error", n_jobs= 10, verbose = 1)
      xgbGrid.fit(X,y)
      xgb_best = xgbGrid.best_estimator_

      for my understanding, this should not take that long.<br/>
      it d


      does not go to the next step I do not sure this even working or not

      it stop with




      Fitting 5 folds for each of 8 candidates, totalling 40 fits
      [Parallel(n_jobs=10)]: Using backend LokyBackend with 10 concurrent
      workers.




      data set size is (15035, 22)
      am I doing something wrong?









      share









      $endgroup$




      just strange



      %%time
      xgb = xgb.XGBRegressor(n_estimators=500, learning_rate=0.07, gamma=0, subsample=0.75, colsample_bytree=1,
      max_depth=7, tree_method='gpu_exact')


      this code takes around Wall time: 866 ms.



      but when I do the gridsearchCV it does not goes to the next step

      even though I gave only one parameter



       %%time
      xgb = XGBClassifier(tree_method='gpu_exact',verbose_eval=True, silence=False)
      kfold = StratifiedKFold(n_splits=10, random_state=0)
      xgb_param_grid =
      'learning_rate': [0.08,0.09],
      'random_state': [0],
      'max_depth': [8,9],
      'n_estimators': [400,500]

      xgbGrid = gsRFC = GridSearchCV(xgb,param_grid = xgb_param_grid, cv=5, scoring="neg_mean_squared_error", n_jobs= 10, verbose = 1)
      xgbGrid.fit(X,y)
      xgb_best = xgbGrid.best_estimator_

      for my understanding, this should not take that long.<br/>
      it d


      does not go to the next step I do not sure this even working or not

      it stop with




      Fitting 5 folds for each of 8 candidates, totalling 40 fits
      [Parallel(n_jobs=10)]: Using backend LokyBackend with 10 concurrent
      workers.




      data set size is (15035, 22)
      am I doing something wrong?







      machine-learning xgboost kaggle grid-search gridsearchcv





      share












      share










      share



      share










      asked 3 mins ago









      monkmonk

      164




      164




















          0






          active

          oldest

          votes












          Your Answer








          StackExchange.ready(function()
          var channelOptions =
          tags: "".split(" "),
          id: "557"
          ;
          initTagRenderer("".split(" "), "".split(" "), channelOptions);

          StackExchange.using("externalEditor", function()
          // Have to fire editor after snippets, if snippets enabled
          if (StackExchange.settings.snippets.snippetsEnabled)
          StackExchange.using("snippets", function()
          createEditor();
          );

          else
          createEditor();

          );

          function createEditor()
          StackExchange.prepareEditor(
          heartbeatType: 'answer',
          autoActivateHeartbeat: false,
          convertImagesToLinks: false,
          noModals: true,
          showLowRepImageUploadWarning: true,
          reputationToPostImages: null,
          bindNavPrevention: true,
          postfix: "",
          imageUploader:
          brandingHtml: "Powered by u003ca class="icon-imgur-white" href="https://imgur.com/"u003eu003c/au003e",
          contentPolicyHtml: "User contributions licensed under u003ca href="https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/"u003ecc by-sa 3.0 with attribution requiredu003c/au003e u003ca href="https://stackoverflow.com/legal/content-policy"u003e(content policy)u003c/au003e",
          allowUrls: true
          ,
          onDemand: true,
          discardSelector: ".discard-answer"
          ,immediatelyShowMarkdownHelp:true
          );



          );













          draft saved

          draft discarded


















          StackExchange.ready(
          function ()
          StackExchange.openid.initPostLogin('.new-post-login', 'https%3a%2f%2fdatascience.stackexchange.com%2fquestions%2f49297%2fxgboost-gridsearchcv-take-too-long-or-does-not-goes-to-the-next-step%23new-answer', 'question_page');

          );

          Post as a guest















          Required, but never shown

























          0






          active

          oldest

          votes








          0






          active

          oldest

          votes









          active

          oldest

          votes






          active

          oldest

          votes















          draft saved

          draft discarded
















































          Thanks for contributing an answer to Data Science Stack Exchange!


          • Please be sure to answer the question. Provide details and share your research!

          But avoid


          • Asking for help, clarification, or responding to other answers.

          • Making statements based on opinion; back them up with references or personal experience.

          Use MathJax to format equations. MathJax reference.


          To learn more, see our tips on writing great answers.




          draft saved


          draft discarded














          StackExchange.ready(
          function ()
          StackExchange.openid.initPostLogin('.new-post-login', 'https%3a%2f%2fdatascience.stackexchange.com%2fquestions%2f49297%2fxgboost-gridsearchcv-take-too-long-or-does-not-goes-to-the-next-step%23new-answer', 'question_page');

          );

          Post as a guest















          Required, but never shown





















































          Required, but never shown














          Required, but never shown












          Required, but never shown







          Required, but never shown

































          Required, but never shown














          Required, but never shown












          Required, but never shown







          Required, but never shown







          Popular posts from this blog

          Францішак Багушэвіч Змест Сям'я | Біяграфія | Творчасць | Мова Багушэвіча | Ацэнкі дзейнасці | Цікавыя факты | Спадчына | Выбраная бібліяграфія | Ушанаванне памяці | У філатэліі | Зноскі | Літаратура | Спасылкі | НавігацыяЛяхоўскі У. Рупіўся дзеля Бога і людзей: Жыццёвы шлях Лявона Вітан-Дубейкаўскага // Вольскі і Памідораў з песняй пра немца Адвакат, паэт, народны заступнік Ашмянскі веснікВ Минске появится площадь Богушевича и улица Сырокомли, Белорусская деловая газета, 19 июля 2001 г.Айцец беларускай нацыянальнай ідэі паўстаў у бронзе Сяргей Аляксандравіч Адашкевіч (1918, Мінск). 80-я гады. Бюст «Францішак Багушэвіч».Яўген Мікалаевіч Ціхановіч. «Партрэт Францішка Багушэвіча»Мікола Мікалаевіч Купава. «Партрэт зачынальніка новай беларускай літаратуры Францішка Багушэвіча»Уладзімір Іванавіч Мелехаў. На помніку «Змагарам за родную мову» Барэльеф «Францішак Багушэвіч»Памяць пра Багушэвіча на Віленшчыне Страчаная сталіца. Беларускія шыльды на вуліцах Вільні«Krynica». Ideologia i przywódcy białoruskiego katolicyzmuФранцішак БагушэвічТворы на knihi.comТворы Францішка Багушэвіча на bellib.byСодаль Уладзімір. Францішак Багушэвіч на Лідчыне;Луцкевіч Антон. Жыцьцё і творчасьць Фр. Багушэвіча ў успамінах ягоных сучасьнікаў // Запісы Беларускага Навуковага таварыства. Вільня, 1938. Сшытак 1. С. 16-34.Большая российская1188761710000 0000 5537 633Xn9209310021619551927869394п

          Беларусь Змест Назва Гісторыя Геаграфія Сімволіка Дзяржаўны лад Палітычныя партыі Міжнароднае становішча і знешняя палітыка Адміністрацыйны падзел Насельніцтва Эканоміка Культура і грамадства Сацыяльная сфера Узброеныя сілы Заўвагі Літаратура Спасылкі НавігацыяHGЯOiТоп-2011 г. (па версіі ej.by)Топ-2013 г. (па версіі ej.by)Топ-2016 г. (па версіі ej.by)Топ-2017 г. (па версіі ej.by)Нацыянальны статыстычны камітэт Рэспублікі БеларусьШчыльнасць насельніцтва па краінахhttp://naviny.by/rubrics/society/2011/09/16/ic_articles_116_175144/А. Калечыц, У. Ксяндзоў. Спробы засялення краю неандэртальскім чалавекам.І ў Менску былі мамантыА. Калечыц, У. Ксяндзоў. Старажытны каменны век (палеаліт). Першапачатковае засяленне тэрыторыіГ. Штыхаў. Балты і славяне ў VI—VIII стст.М. Клімаў. Полацкае княства ў IX—XI стст.Г. Штыхаў, В. Ляўко. Палітычная гісторыя Полацкай зямліГ. Штыхаў. Дзяржаўны лад у землях-княствахГ. Штыхаў. Дзяржаўны лад у землях-княствахБеларускія землі ў складзе Вялікага Княства ЛітоўскагаЛюблінская унія 1569 г."The Early Stages of Independence"Zapomniane prawdy25 гадоў таму было аб'яўлена, што Язэп Пілсудскі — беларус (фота)Наша вадаДакументы ЧАЭС: Забруджванне тэрыторыі Беларусі « ЧАЭС Зона адчужэнняСведения о политических партиях, зарегистрированных в Республике Беларусь // Министерство юстиции Республики БеларусьСтатыстычны бюлетэнь „Полаўзроставая структура насельніцтва Рэспублікі Беларусь на 1 студзеня 2012 года і сярэднегадовая колькасць насельніцтва за 2011 год“Индекс человеческого развития Беларуси — не было бы нижеБеларусь занимает первое место в СНГ по индексу развития с учетом гендерного факцёраНацыянальны статыстычны камітэт Рэспублікі БеларусьКанстытуцыя РБ. Артыкул 17Трансфармацыйныя задачы БеларусіВыйсце з крызісу — далейшае рэфармаванне Беларускі рубель — сусветны лідар па дэвальвацыяхПра змену коштаў у кастрычніку 2011 г.Бядней за беларусаў у СНД толькі таджыкіСярэдні заробак у верасні дасягнуў 2,26 мільёна рублёўЭканомікаГаласуем за ТОП-100 беларускай прозыСучасныя беларускія мастакіАрхитектура Беларуси BELARUS.BYА. Каханоўскі. Культура Беларусі ўсярэдзіне XVII—XVIII ст.Анталогія беларускай народнай песні, гуказапісы спеваўБеларускія Музычныя IнструментыБеларускі рок, які мы страцілі. Топ-10 гуртоў«Мясцовы час» — нязгаслая легенда беларускай рок-музыкіСЯРГЕЙ БУДКІН. МЫ НЯ ЗНАЕМ СВАЁЙ МУЗЫКІМ. А. Каладзінскі. НАРОДНЫ ТЭАТРМагнацкія культурныя цэнтрыПублічная дыскусія «Беларуская новая пьеса: без беларускай мовы ці беларуская?»Беларускія драматургі па-ранейшаму лепш ставяцца за мяжой, чым на радзіме«Працэс незалежнага кіно пайшоў, і дзяржаву турбуе яго непадкантрольнасць»Беларускія філосафы ў пошуках прасторыВсе идём в библиотекуАрхіваванаАб Нацыянальнай праграме даследавання і выкарыстання касмічнай прасторы ў мірных мэтах на 2008—2012 гадыУ космас — разам.У суседнім з Барысаўскім раёне пабудуюць Камандна-вымяральны пунктСвяты і абрады беларусаў«Мірныя бульбашы з малой краіны» — 5 непраўдзівых стэрэатыпаў пра БеларусьМ. Раманюк. Беларускае народнае адзеннеУ Беларусі скарачаецца колькасць злачынстваўЛукашэнка незадаволены мінскімі ўладамі Крадзяжы складаюць у Мінску каля 70% злачынстваў Узровень злачыннасці ў Мінскай вобласці — адзін з самых высокіх у краіне Генпракуратура аналізуе стан са злачыннасцю ў Беларусі па каэфіцыенце злачыннасці У Беларусі стабілізавалася крымінагеннае становішча, лічыць генпракурорЗамежнікі сталі здзяйсняць у Беларусі больш злачынстваўМУС Беларусі турбуе рост рэцыдыўнай злачыннасціЯ з ЖЭСа. Дазволіце вас абкрасці! Рэйтынг усіх службаў і падраздзяленняў ГУУС Мінгарвыканкама вырасАб КДБ РБГісторыя Аператыўна-аналітычнага цэнтра РБГісторыя ДКФРТаможняagentura.ruБеларусьBelarus.by — Афіцыйны сайт Рэспублікі БеларусьСайт урада БеларусіRadzima.org — Збор архітэктурных помнікаў, гісторыя Беларусі«Глобус Беларуси»Гербы и флаги БеларусиАсаблівасці каменнага веку на БеларусіА. Калечыц, У. Ксяндзоў. Старажытны каменны век (палеаліт). Першапачатковае засяленне тэрыторыіУ. Ксяндзоў. Сярэдні каменны век (мезаліт). Засяленне краю плямёнамі паляўнічых, рыбакоў і збіральнікаўА. Калечыц, М. Чарняўскі. Плямёны на тэрыторыі Беларусі ў новым каменным веку (неаліце)А. Калечыц, У. Ксяндзоў, М. Чарняўскі. Гаспадарчыя заняткі ў каменным векуЭ. Зайкоўскі. Духоўная культура ў каменным векуАсаблівасці бронзавага веку на БеларусіФарміраванне супольнасцей ранняга перыяду бронзавага векуФотографии БеларусиРоля беларускіх зямель ва ўтварэнні і ўмацаванні ВКЛВ. Фадзеева. З гісторыі развіцця беларускай народнай вышыўкіDMOZGran catalanaБольшая российскаяBritannica (анлайн)Швейцарскі гістарычны15325917611952699xDA123282154079143-90000 0001 2171 2080n9112870100577502ge128882171858027501086026362074122714179пппппп

          ValueError: Expected n_neighbors <= n_samples, but n_samples = 1, n_neighbors = 6 (SMOTE) The 2019 Stack Overflow Developer Survey Results Are InCan SMOTE be applied over sequence of words (sentences)?ValueError when doing validation with random forestsSMOTE and multi class oversamplingLogic behind SMOTE-NC?ValueError: Error when checking target: expected dense_1 to have shape (7,) but got array with shape (1,)SmoteBoost: Should SMOTE be ran individually for each iteration/tree in the boosting?solving multi-class imbalance classification using smote and OSSUsing SMOTE for Synthetic Data generation to improve performance on unbalanced dataproblem of entry format for a simple model in KerasSVM SMOTE fit_resample() function runs forever with no result