KShape cluster centers offset?How to classify and cluster this time series dataCluster Similar Images into FoldersDatamodel for cluster analysis terms & segmentationIs this cluster analysis / prediction?How to cluster multiple time-series from one data frameCluster documents and identify the prominent document in the cluster?Notion of cluster centers and cluster comparison in Density Based AlgorithmsMeasuring document cluster cohesionClustering time series based on monotonic similarityUsing K-prototypes algorithm to cluster gdelt data by country

Re-entry to Germany after vacation using blue card

Alignment of various blocks in tikz

Why must Chinese maps be obfuscated?

Is it idiomatic to construct against `this`

Why do games have consumables?

Converting a sprinkler system's 24V AC outputs to 3.3V DC logic inputs

How can Republicans who favour free markets, consistently express anger when they don't like the outcome of that choice?

"The cow" OR "a cow" OR "cows" in this context

Can someone publish a story that happened to you?

Two field separators (colon and space) in awk

Apply MapThread to all but one variable

If a planet has 3 moons, is it possible to have triple Full/New Moons at once?

What are the steps to solving this definite integral?

Can we say “you can pay when the order gets ready”?

Implications of cigar-shaped bodies having rings?

Elements other than carbon that can form many different compounds by bonding to themselves?

What is causing the white spot to appear in some of my pictures

can anyone help me with this awful query plan?

Phrase for the opposite of "foolproof"

How to not starve gigantic beasts

A strange hotel

How much cash can I safely carry into the USA and avoid civil forfeiture?

Check if a string is entirely made of the same substring

How to stop co-workers from teasing me because I know Russian?



KShape cluster centers offset?


How to classify and cluster this time series dataCluster Similar Images into FoldersDatamodel for cluster analysis terms & segmentationIs this cluster analysis / prediction?How to cluster multiple time-series from one data frameCluster documents and identify the prominent document in the cluster?Notion of cluster centers and cluster comparison in Density Based AlgorithmsMeasuring document cluster cohesionClustering time series based on monotonic similarityUsing K-prototypes algorithm to cluster gdelt data by country













1












$begingroup$


I am using tslearn KShape to cluster time series data. I am generally happy with the results, as upon inspection, the clusters seem to make sense because of the similarity in shape and magnitude. I can see the general shape that emerges as seen in the figures below.



What I find odd is the cluster centers using k_shape.cluster_centers_. There seems to be a significant shift from some of the clusters. I've included two figures illustrating my point. In Cluster 0, the cluster center is plotted as the red line, and there is a significant shift from where that shape actually emerges in the time series. In Cluster 4, the cluster center is much more centered, for lack of a better term.



What could be contributing to the major offset seen in Cluster 0? What I find odd is that not all clusters have such a dramatic offset, and not all are offset to the beginning or the end of the time series. Any thoughts?



offset cluster center



png










share|improve this question









$endgroup$
















    1












    $begingroup$


    I am using tslearn KShape to cluster time series data. I am generally happy with the results, as upon inspection, the clusters seem to make sense because of the similarity in shape and magnitude. I can see the general shape that emerges as seen in the figures below.



    What I find odd is the cluster centers using k_shape.cluster_centers_. There seems to be a significant shift from some of the clusters. I've included two figures illustrating my point. In Cluster 0, the cluster center is plotted as the red line, and there is a significant shift from where that shape actually emerges in the time series. In Cluster 4, the cluster center is much more centered, for lack of a better term.



    What could be contributing to the major offset seen in Cluster 0? What I find odd is that not all clusters have such a dramatic offset, and not all are offset to the beginning or the end of the time series. Any thoughts?



    offset cluster center



    png










    share|improve this question









    $endgroup$














      1












      1








      1





      $begingroup$


      I am using tslearn KShape to cluster time series data. I am generally happy with the results, as upon inspection, the clusters seem to make sense because of the similarity in shape and magnitude. I can see the general shape that emerges as seen in the figures below.



      What I find odd is the cluster centers using k_shape.cluster_centers_. There seems to be a significant shift from some of the clusters. I've included two figures illustrating my point. In Cluster 0, the cluster center is plotted as the red line, and there is a significant shift from where that shape actually emerges in the time series. In Cluster 4, the cluster center is much more centered, for lack of a better term.



      What could be contributing to the major offset seen in Cluster 0? What I find odd is that not all clusters have such a dramatic offset, and not all are offset to the beginning or the end of the time series. Any thoughts?



      offset cluster center



      png










      share|improve this question









      $endgroup$




      I am using tslearn KShape to cluster time series data. I am generally happy with the results, as upon inspection, the clusters seem to make sense because of the similarity in shape and magnitude. I can see the general shape that emerges as seen in the figures below.



      What I find odd is the cluster centers using k_shape.cluster_centers_. There seems to be a significant shift from some of the clusters. I've included two figures illustrating my point. In Cluster 0, the cluster center is plotted as the red line, and there is a significant shift from where that shape actually emerges in the time series. In Cluster 4, the cluster center is much more centered, for lack of a better term.



      What could be contributing to the major offset seen in Cluster 0? What I find odd is that not all clusters have such a dramatic offset, and not all are offset to the beginning or the end of the time series. Any thoughts?



      offset cluster center



      png







      time-series clustering






      share|improve this question













      share|improve this question











      share|improve this question




      share|improve this question










      asked Feb 7 at 19:32









      AAD2AAD2

      62




      62




















          1 Answer
          1






          active

          oldest

          votes


















          0












          $begingroup$

          It turns out that the red shape in each cluster indicates the cluster centroid, which is the shape that all the other shapes in the cluster are compared with. There is an offset occasionally because it's a centroid, and the there may be a some variance within the cluster. For that reason, the standard deviation set in the k-shape algorithm can affect the centroid, with larger standard deviations contributing to less "exact" centroids.






          share|improve this answer









          $endgroup$













            Your Answer








            StackExchange.ready(function()
            var channelOptions =
            tags: "".split(" "),
            id: "557"
            ;
            initTagRenderer("".split(" "), "".split(" "), channelOptions);

            StackExchange.using("externalEditor", function()
            // Have to fire editor after snippets, if snippets enabled
            if (StackExchange.settings.snippets.snippetsEnabled)
            StackExchange.using("snippets", function()
            createEditor();
            );

            else
            createEditor();

            );

            function createEditor()
            StackExchange.prepareEditor(
            heartbeatType: 'answer',
            autoActivateHeartbeat: false,
            convertImagesToLinks: false,
            noModals: true,
            showLowRepImageUploadWarning: true,
            reputationToPostImages: null,
            bindNavPrevention: true,
            postfix: "",
            imageUploader:
            brandingHtml: "Powered by u003ca class="icon-imgur-white" href="https://imgur.com/"u003eu003c/au003e",
            contentPolicyHtml: "User contributions licensed under u003ca href="https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/"u003ecc by-sa 3.0 with attribution requiredu003c/au003e u003ca href="https://stackoverflow.com/legal/content-policy"u003e(content policy)u003c/au003e",
            allowUrls: true
            ,
            onDemand: true,
            discardSelector: ".discard-answer"
            ,immediatelyShowMarkdownHelp:true
            );



            );













            draft saved

            draft discarded


















            StackExchange.ready(
            function ()
            StackExchange.openid.initPostLogin('.new-post-login', 'https%3a%2f%2fdatascience.stackexchange.com%2fquestions%2f45231%2fkshape-cluster-centers-offset%23new-answer', 'question_page');

            );

            Post as a guest















            Required, but never shown

























            1 Answer
            1






            active

            oldest

            votes








            1 Answer
            1






            active

            oldest

            votes









            active

            oldest

            votes






            active

            oldest

            votes









            0












            $begingroup$

            It turns out that the red shape in each cluster indicates the cluster centroid, which is the shape that all the other shapes in the cluster are compared with. There is an offset occasionally because it's a centroid, and the there may be a some variance within the cluster. For that reason, the standard deviation set in the k-shape algorithm can affect the centroid, with larger standard deviations contributing to less "exact" centroids.






            share|improve this answer









            $endgroup$

















              0












              $begingroup$

              It turns out that the red shape in each cluster indicates the cluster centroid, which is the shape that all the other shapes in the cluster are compared with. There is an offset occasionally because it's a centroid, and the there may be a some variance within the cluster. For that reason, the standard deviation set in the k-shape algorithm can affect the centroid, with larger standard deviations contributing to less "exact" centroids.






              share|improve this answer









              $endgroup$















                0












                0








                0





                $begingroup$

                It turns out that the red shape in each cluster indicates the cluster centroid, which is the shape that all the other shapes in the cluster are compared with. There is an offset occasionally because it's a centroid, and the there may be a some variance within the cluster. For that reason, the standard deviation set in the k-shape algorithm can affect the centroid, with larger standard deviations contributing to less "exact" centroids.






                share|improve this answer









                $endgroup$



                It turns out that the red shape in each cluster indicates the cluster centroid, which is the shape that all the other shapes in the cluster are compared with. There is an offset occasionally because it's a centroid, and the there may be a some variance within the cluster. For that reason, the standard deviation set in the k-shape algorithm can affect the centroid, with larger standard deviations contributing to less "exact" centroids.







                share|improve this answer












                share|improve this answer



                share|improve this answer










                answered 10 mins ago









                AAD2AAD2

                62




                62



























                    draft saved

                    draft discarded
















































                    Thanks for contributing an answer to Data Science Stack Exchange!


                    • Please be sure to answer the question. Provide details and share your research!

                    But avoid


                    • Asking for help, clarification, or responding to other answers.

                    • Making statements based on opinion; back them up with references or personal experience.

                    Use MathJax to format equations. MathJax reference.


                    To learn more, see our tips on writing great answers.




                    draft saved


                    draft discarded














                    StackExchange.ready(
                    function ()
                    StackExchange.openid.initPostLogin('.new-post-login', 'https%3a%2f%2fdatascience.stackexchange.com%2fquestions%2f45231%2fkshape-cluster-centers-offset%23new-answer', 'question_page');

                    );

                    Post as a guest















                    Required, but never shown





















































                    Required, but never shown














                    Required, but never shown












                    Required, but never shown







                    Required, but never shown

































                    Required, but never shown














                    Required, but never shown












                    Required, but never shown







                    Required, but never shown







                    Popular posts from this blog

                    Францішак Багушэвіч Змест Сям'я | Біяграфія | Творчасць | Мова Багушэвіча | Ацэнкі дзейнасці | Цікавыя факты | Спадчына | Выбраная бібліяграфія | Ушанаванне памяці | У філатэліі | Зноскі | Літаратура | Спасылкі | НавігацыяЛяхоўскі У. Рупіўся дзеля Бога і людзей: Жыццёвы шлях Лявона Вітан-Дубейкаўскага // Вольскі і Памідораў з песняй пра немца Адвакат, паэт, народны заступнік Ашмянскі веснікВ Минске появится площадь Богушевича и улица Сырокомли, Белорусская деловая газета, 19 июля 2001 г.Айцец беларускай нацыянальнай ідэі паўстаў у бронзе Сяргей Аляксандравіч Адашкевіч (1918, Мінск). 80-я гады. Бюст «Францішак Багушэвіч».Яўген Мікалаевіч Ціхановіч. «Партрэт Францішка Багушэвіча»Мікола Мікалаевіч Купава. «Партрэт зачынальніка новай беларускай літаратуры Францішка Багушэвіча»Уладзімір Іванавіч Мелехаў. На помніку «Змагарам за родную мову» Барэльеф «Францішак Багушэвіч»Памяць пра Багушэвіча на Віленшчыне Страчаная сталіца. Беларускія шыльды на вуліцах Вільні«Krynica». Ideologia i przywódcy białoruskiego katolicyzmuФранцішак БагушэвічТворы на knihi.comТворы Францішка Багушэвіча на bellib.byСодаль Уладзімір. Францішак Багушэвіч на Лідчыне;Луцкевіч Антон. Жыцьцё і творчасьць Фр. Багушэвіча ў успамінах ягоных сучасьнікаў // Запісы Беларускага Навуковага таварыства. Вільня, 1938. Сшытак 1. С. 16-34.Большая российская1188761710000 0000 5537 633Xn9209310021619551927869394п

                    Беларусь Змест Назва Гісторыя Геаграфія Сімволіка Дзяржаўны лад Палітычныя партыі Міжнароднае становішча і знешняя палітыка Адміністрацыйны падзел Насельніцтва Эканоміка Культура і грамадства Сацыяльная сфера Узброеныя сілы Заўвагі Літаратура Спасылкі НавігацыяHGЯOiТоп-2011 г. (па версіі ej.by)Топ-2013 г. (па версіі ej.by)Топ-2016 г. (па версіі ej.by)Топ-2017 г. (па версіі ej.by)Нацыянальны статыстычны камітэт Рэспублікі БеларусьШчыльнасць насельніцтва па краінахhttp://naviny.by/rubrics/society/2011/09/16/ic_articles_116_175144/А. Калечыц, У. Ксяндзоў. Спробы засялення краю неандэртальскім чалавекам.І ў Менску былі мамантыА. Калечыц, У. Ксяндзоў. Старажытны каменны век (палеаліт). Першапачатковае засяленне тэрыторыіГ. Штыхаў. Балты і славяне ў VI—VIII стст.М. Клімаў. Полацкае княства ў IX—XI стст.Г. Штыхаў, В. Ляўко. Палітычная гісторыя Полацкай зямліГ. Штыхаў. Дзяржаўны лад у землях-княствахГ. Штыхаў. Дзяржаўны лад у землях-княствахБеларускія землі ў складзе Вялікага Княства ЛітоўскагаЛюблінская унія 1569 г."The Early Stages of Independence"Zapomniane prawdy25 гадоў таму было аб'яўлена, што Язэп Пілсудскі — беларус (фота)Наша вадаДакументы ЧАЭС: Забруджванне тэрыторыі Беларусі « ЧАЭС Зона адчужэнняСведения о политических партиях, зарегистрированных в Республике Беларусь // Министерство юстиции Республики БеларусьСтатыстычны бюлетэнь „Полаўзроставая структура насельніцтва Рэспублікі Беларусь на 1 студзеня 2012 года і сярэднегадовая колькасць насельніцтва за 2011 год“Индекс человеческого развития Беларуси — не было бы нижеБеларусь занимает первое место в СНГ по индексу развития с учетом гендерного факцёраНацыянальны статыстычны камітэт Рэспублікі БеларусьКанстытуцыя РБ. Артыкул 17Трансфармацыйныя задачы БеларусіВыйсце з крызісу — далейшае рэфармаванне Беларускі рубель — сусветны лідар па дэвальвацыяхПра змену коштаў у кастрычніку 2011 г.Бядней за беларусаў у СНД толькі таджыкіСярэдні заробак у верасні дасягнуў 2,26 мільёна рублёўЭканомікаГаласуем за ТОП-100 беларускай прозыСучасныя беларускія мастакіАрхитектура Беларуси BELARUS.BYА. Каханоўскі. Культура Беларусі ўсярэдзіне XVII—XVIII ст.Анталогія беларускай народнай песні, гуказапісы спеваўБеларускія Музычныя IнструментыБеларускі рок, які мы страцілі. Топ-10 гуртоў«Мясцовы час» — нязгаслая легенда беларускай рок-музыкіСЯРГЕЙ БУДКІН. МЫ НЯ ЗНАЕМ СВАЁЙ МУЗЫКІМ. А. Каладзінскі. НАРОДНЫ ТЭАТРМагнацкія культурныя цэнтрыПублічная дыскусія «Беларуская новая пьеса: без беларускай мовы ці беларуская?»Беларускія драматургі па-ранейшаму лепш ставяцца за мяжой, чым на радзіме«Працэс незалежнага кіно пайшоў, і дзяржаву турбуе яго непадкантрольнасць»Беларускія філосафы ў пошуках прасторыВсе идём в библиотекуАрхіваванаАб Нацыянальнай праграме даследавання і выкарыстання касмічнай прасторы ў мірных мэтах на 2008—2012 гадыУ космас — разам.У суседнім з Барысаўскім раёне пабудуюць Камандна-вымяральны пунктСвяты і абрады беларусаў«Мірныя бульбашы з малой краіны» — 5 непраўдзівых стэрэатыпаў пра БеларусьМ. Раманюк. Беларускае народнае адзеннеУ Беларусі скарачаецца колькасць злачынстваўЛукашэнка незадаволены мінскімі ўладамі Крадзяжы складаюць у Мінску каля 70% злачынстваў Узровень злачыннасці ў Мінскай вобласці — адзін з самых высокіх у краіне Генпракуратура аналізуе стан са злачыннасцю ў Беларусі па каэфіцыенце злачыннасці У Беларусі стабілізавалася крымінагеннае становішча, лічыць генпракурорЗамежнікі сталі здзяйсняць у Беларусі больш злачынстваўМУС Беларусі турбуе рост рэцыдыўнай злачыннасціЯ з ЖЭСа. Дазволіце вас абкрасці! Рэйтынг усіх службаў і падраздзяленняў ГУУС Мінгарвыканкама вырасАб КДБ РБГісторыя Аператыўна-аналітычнага цэнтра РБГісторыя ДКФРТаможняagentura.ruБеларусьBelarus.by — Афіцыйны сайт Рэспублікі БеларусьСайт урада БеларусіRadzima.org — Збор архітэктурных помнікаў, гісторыя Беларусі«Глобус Беларуси»Гербы и флаги БеларусиАсаблівасці каменнага веку на БеларусіА. Калечыц, У. Ксяндзоў. Старажытны каменны век (палеаліт). Першапачатковае засяленне тэрыторыіУ. Ксяндзоў. Сярэдні каменны век (мезаліт). Засяленне краю плямёнамі паляўнічых, рыбакоў і збіральнікаўА. Калечыц, М. Чарняўскі. Плямёны на тэрыторыі Беларусі ў новым каменным веку (неаліце)А. Калечыц, У. Ксяндзоў, М. Чарняўскі. Гаспадарчыя заняткі ў каменным векуЭ. Зайкоўскі. Духоўная культура ў каменным векуАсаблівасці бронзавага веку на БеларусіФарміраванне супольнасцей ранняга перыяду бронзавага векуФотографии БеларусиРоля беларускіх зямель ва ўтварэнні і ўмацаванні ВКЛВ. Фадзеева. З гісторыі развіцця беларускай народнай вышыўкіDMOZGran catalanaБольшая российскаяBritannica (анлайн)Швейцарскі гістарычны15325917611952699xDA123282154079143-90000 0001 2171 2080n9112870100577502ge128882171858027501086026362074122714179пппппп

                    ValueError: Expected n_neighbors <= n_samples, but n_samples = 1, n_neighbors = 6 (SMOTE) The 2019 Stack Overflow Developer Survey Results Are InCan SMOTE be applied over sequence of words (sentences)?ValueError when doing validation with random forestsSMOTE and multi class oversamplingLogic behind SMOTE-NC?ValueError: Error when checking target: expected dense_1 to have shape (7,) but got array with shape (1,)SmoteBoost: Should SMOTE be ran individually for each iteration/tree in the boosting?solving multi-class imbalance classification using smote and OSSUsing SMOTE for Synthetic Data generation to improve performance on unbalanced dataproblem of entry format for a simple model in KerasSVM SMOTE fit_resample() function runs forever with no result