Multi task learning with missing labels in Keras tutorial question The Next CEO of Stack Overflow2019 Community Moderator ElectionOnline machine learning tutorialHow to deal with string labels in multi-class classification with keras?Evaluating machine learning model with missing featuresMulti-task learning for Multi-label classification?Multitask learning NN only trains on a few tasksMulti task learning in KerasMulti task learning architecture for Multi-label classificationWhy is my Keras model not learning image segmentation?Training multi-label classifier with unbalanced samples in KerasApplying CNN for cross sectional data

Read/write a pipe-delimited file line by line with some simple text manipulation

Prodigo = pro + ago?

Can Sri Krishna be called 'a person'?

Direct Implications Between USA and UK in Event of No-Deal Brexit

Does the Idaho Potato Commission associate potato skins with healthy eating?

Why was Sir Cadogan fired?

Compilation of a 2d array and a 1d array

How can I separate the number from the unit in argument?

Find a path from s to t using as few red nodes as possible

My ex-girlfriend uses my Apple ID to login to her iPad, do I have to give her my Apple ID password to reset it?

Is it reasonable to ask other researchers to send me their previous grant applications?

Finitely generated matrix groups whose eigenvalues are all algebraic

Could a dragon use its wings to swim?

Planeswalker Ability and Death Timing

How do I secure a TV wall mount?

Is it okay to majorly distort historical facts while writing a fiction story?

Why does freezing point matter when picking cooler ice packs?

Avoiding the "not like other girls" trope?

Can I cast Thunderwave and be at the center of its bottom face, but not be affected by it?

How do I keep Mac Emacs from trapping M-`?

Calculating discount not working

What day is it again?

Masking layers by a vector polygon layer in QGIS

Physiological effects of huge anime eyes



Multi task learning with missing labels in Keras tutorial question



The Next CEO of Stack Overflow
2019 Community Moderator ElectionOnline machine learning tutorialHow to deal with string labels in multi-class classification with keras?Evaluating machine learning model with missing featuresMulti-task learning for Multi-label classification?Multitask learning NN only trains on a few tasksMulti task learning in KerasMulti task learning architecture for Multi-label classificationWhy is my Keras model not learning image segmentation?Training multi-label classifier with unbalanced samples in KerasApplying CNN for cross sectional data










0












$begingroup$


https://www.dlology.com/blog/how-to-multi-task-learning-with-missing-labels-in-keras/



I followed this tutorial to create a multi task model for binary classification with missing labels in keras. The dataset that I'm using has inputs in the form of 167 length bit strings consisting of ones and zeroes (represent chemical structures), and the output is 12 binary labels representing toxicity of assays. I pretty much copied the tutorial exactly except for replacing their data with my curated dataset, and I'm getting 11% accuracy on my test set. I'm extremely confused about how the tutorial's masked_loss_function works, and I would appreciate any input on how to improve my model:



from keras import backend as K
def masked_loss_function(y_true, y_pred):
mask = K.cast(K.not_equal(y_true, mask_value), K.floatx())
return K.binary_crossentropy(y_true * mask, y_pred * mask)

model.compile(loss=masked_loss_function, optimizer='adam', metrics=['accuracy'])


Thanks so much!










share|improve this question









New contributor




scouts9 is a new contributor to this site. Take care in asking for clarification, commenting, and answering.
Check out our Code of Conduct.







$endgroup$
















    0












    $begingroup$


    https://www.dlology.com/blog/how-to-multi-task-learning-with-missing-labels-in-keras/



    I followed this tutorial to create a multi task model for binary classification with missing labels in keras. The dataset that I'm using has inputs in the form of 167 length bit strings consisting of ones and zeroes (represent chemical structures), and the output is 12 binary labels representing toxicity of assays. I pretty much copied the tutorial exactly except for replacing their data with my curated dataset, and I'm getting 11% accuracy on my test set. I'm extremely confused about how the tutorial's masked_loss_function works, and I would appreciate any input on how to improve my model:



    from keras import backend as K
    def masked_loss_function(y_true, y_pred):
    mask = K.cast(K.not_equal(y_true, mask_value), K.floatx())
    return K.binary_crossentropy(y_true * mask, y_pred * mask)

    model.compile(loss=masked_loss_function, optimizer='adam', metrics=['accuracy'])


    Thanks so much!










    share|improve this question









    New contributor




    scouts9 is a new contributor to this site. Take care in asking for clarification, commenting, and answering.
    Check out our Code of Conduct.







    $endgroup$














      0












      0








      0





      $begingroup$


      https://www.dlology.com/blog/how-to-multi-task-learning-with-missing-labels-in-keras/



      I followed this tutorial to create a multi task model for binary classification with missing labels in keras. The dataset that I'm using has inputs in the form of 167 length bit strings consisting of ones and zeroes (represent chemical structures), and the output is 12 binary labels representing toxicity of assays. I pretty much copied the tutorial exactly except for replacing their data with my curated dataset, and I'm getting 11% accuracy on my test set. I'm extremely confused about how the tutorial's masked_loss_function works, and I would appreciate any input on how to improve my model:



      from keras import backend as K
      def masked_loss_function(y_true, y_pred):
      mask = K.cast(K.not_equal(y_true, mask_value), K.floatx())
      return K.binary_crossentropy(y_true * mask, y_pred * mask)

      model.compile(loss=masked_loss_function, optimizer='adam', metrics=['accuracy'])


      Thanks so much!










      share|improve this question









      New contributor




      scouts9 is a new contributor to this site. Take care in asking for clarification, commenting, and answering.
      Check out our Code of Conduct.







      $endgroup$




      https://www.dlology.com/blog/how-to-multi-task-learning-with-missing-labels-in-keras/



      I followed this tutorial to create a multi task model for binary classification with missing labels in keras. The dataset that I'm using has inputs in the form of 167 length bit strings consisting of ones and zeroes (represent chemical structures), and the output is 12 binary labels representing toxicity of assays. I pretty much copied the tutorial exactly except for replacing their data with my curated dataset, and I'm getting 11% accuracy on my test set. I'm extremely confused about how the tutorial's masked_loss_function works, and I would appreciate any input on how to improve my model:



      from keras import backend as K
      def masked_loss_function(y_true, y_pred):
      mask = K.cast(K.not_equal(y_true, mask_value), K.floatx())
      return K.binary_crossentropy(y_true * mask, y_pred * mask)

      model.compile(loss=masked_loss_function, optimizer='adam', metrics=['accuracy'])


      Thanks so much!







      classification keras beginner multitask-learning






      share|improve this question









      New contributor




      scouts9 is a new contributor to this site. Take care in asking for clarification, commenting, and answering.
      Check out our Code of Conduct.











      share|improve this question









      New contributor




      scouts9 is a new contributor to this site. Take care in asking for clarification, commenting, and answering.
      Check out our Code of Conduct.









      share|improve this question




      share|improve this question








      edited 1 hour ago









      oW_

      3,271932




      3,271932






      New contributor




      scouts9 is a new contributor to this site. Take care in asking for clarification, commenting, and answering.
      Check out our Code of Conduct.









      asked 1 hour ago









      scouts9scouts9

      11




      11




      New contributor




      scouts9 is a new contributor to this site. Take care in asking for clarification, commenting, and answering.
      Check out our Code of Conduct.





      New contributor





      scouts9 is a new contributor to this site. Take care in asking for clarification, commenting, and answering.
      Check out our Code of Conduct.






      scouts9 is a new contributor to this site. Take care in asking for clarification, commenting, and answering.
      Check out our Code of Conduct.




















          0






          active

          oldest

          votes












          Your Answer





          StackExchange.ifUsing("editor", function ()
          return StackExchange.using("mathjaxEditing", function ()
          StackExchange.MarkdownEditor.creationCallbacks.add(function (editor, postfix)
          StackExchange.mathjaxEditing.prepareWmdForMathJax(editor, postfix, [["$", "$"], ["\\(","\\)"]]);
          );
          );
          , "mathjax-editing");

          StackExchange.ready(function()
          var channelOptions =
          tags: "".split(" "),
          id: "557"
          ;
          initTagRenderer("".split(" "), "".split(" "), channelOptions);

          StackExchange.using("externalEditor", function()
          // Have to fire editor after snippets, if snippets enabled
          if (StackExchange.settings.snippets.snippetsEnabled)
          StackExchange.using("snippets", function()
          createEditor();
          );

          else
          createEditor();

          );

          function createEditor()
          StackExchange.prepareEditor(
          heartbeatType: 'answer',
          autoActivateHeartbeat: false,
          convertImagesToLinks: false,
          noModals: true,
          showLowRepImageUploadWarning: true,
          reputationToPostImages: null,
          bindNavPrevention: true,
          postfix: "",
          imageUploader:
          brandingHtml: "Powered by u003ca class="icon-imgur-white" href="https://imgur.com/"u003eu003c/au003e",
          contentPolicyHtml: "User contributions licensed under u003ca href="https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/"u003ecc by-sa 3.0 with attribution requiredu003c/au003e u003ca href="https://stackoverflow.com/legal/content-policy"u003e(content policy)u003c/au003e",
          allowUrls: true
          ,
          onDemand: true,
          discardSelector: ".discard-answer"
          ,immediatelyShowMarkdownHelp:true
          );



          );






          scouts9 is a new contributor. Be nice, and check out our Code of Conduct.









          draft saved

          draft discarded


















          StackExchange.ready(
          function ()
          StackExchange.openid.initPostLogin('.new-post-login', 'https%3a%2f%2fdatascience.stackexchange.com%2fquestions%2f48382%2fmulti-task-learning-with-missing-labels-in-keras-tutorial-question%23new-answer', 'question_page');

          );

          Post as a guest















          Required, but never shown

























          0






          active

          oldest

          votes








          0






          active

          oldest

          votes









          active

          oldest

          votes






          active

          oldest

          votes








          scouts9 is a new contributor. Be nice, and check out our Code of Conduct.









          draft saved

          draft discarded


















          scouts9 is a new contributor. Be nice, and check out our Code of Conduct.












          scouts9 is a new contributor. Be nice, and check out our Code of Conduct.











          scouts9 is a new contributor. Be nice, and check out our Code of Conduct.














          Thanks for contributing an answer to Data Science Stack Exchange!


          • Please be sure to answer the question. Provide details and share your research!

          But avoid


          • Asking for help, clarification, or responding to other answers.

          • Making statements based on opinion; back them up with references or personal experience.

          Use MathJax to format equations. MathJax reference.


          To learn more, see our tips on writing great answers.




          draft saved


          draft discarded














          StackExchange.ready(
          function ()
          StackExchange.openid.initPostLogin('.new-post-login', 'https%3a%2f%2fdatascience.stackexchange.com%2fquestions%2f48382%2fmulti-task-learning-with-missing-labels-in-keras-tutorial-question%23new-answer', 'question_page');

          );

          Post as a guest















          Required, but never shown





















































          Required, but never shown














          Required, but never shown












          Required, but never shown







          Required, but never shown

































          Required, but never shown














          Required, but never shown












          Required, but never shown







          Required, but never shown







          Popular posts from this blog

          Францішак Багушэвіч Змест Сям'я | Біяграфія | Творчасць | Мова Багушэвіча | Ацэнкі дзейнасці | Цікавыя факты | Спадчына | Выбраная бібліяграфія | Ушанаванне памяці | У філатэліі | Зноскі | Літаратура | Спасылкі | НавігацыяЛяхоўскі У. Рупіўся дзеля Бога і людзей: Жыццёвы шлях Лявона Вітан-Дубейкаўскага // Вольскі і Памідораў з песняй пра немца Адвакат, паэт, народны заступнік Ашмянскі веснікВ Минске появится площадь Богушевича и улица Сырокомли, Белорусская деловая газета, 19 июля 2001 г.Айцец беларускай нацыянальнай ідэі паўстаў у бронзе Сяргей Аляксандравіч Адашкевіч (1918, Мінск). 80-я гады. Бюст «Францішак Багушэвіч».Яўген Мікалаевіч Ціхановіч. «Партрэт Францішка Багушэвіча»Мікола Мікалаевіч Купава. «Партрэт зачынальніка новай беларускай літаратуры Францішка Багушэвіча»Уладзімір Іванавіч Мелехаў. На помніку «Змагарам за родную мову» Барэльеф «Францішак Багушэвіч»Памяць пра Багушэвіча на Віленшчыне Страчаная сталіца. Беларускія шыльды на вуліцах Вільні«Krynica». Ideologia i przywódcy białoruskiego katolicyzmuФранцішак БагушэвічТворы на knihi.comТворы Францішка Багушэвіча на bellib.byСодаль Уладзімір. Францішак Багушэвіч на Лідчыне;Луцкевіч Антон. Жыцьцё і творчасьць Фр. Багушэвіча ў успамінах ягоных сучасьнікаў // Запісы Беларускага Навуковага таварыства. Вільня, 1938. Сшытак 1. С. 16-34.Большая российская1188761710000 0000 5537 633Xn9209310021619551927869394п

          Беларусь Змест Назва Гісторыя Геаграфія Сімволіка Дзяржаўны лад Палітычныя партыі Міжнароднае становішча і знешняя палітыка Адміністрацыйны падзел Насельніцтва Эканоміка Культура і грамадства Сацыяльная сфера Узброеныя сілы Заўвагі Літаратура Спасылкі НавігацыяHGЯOiТоп-2011 г. (па версіі ej.by)Топ-2013 г. (па версіі ej.by)Топ-2016 г. (па версіі ej.by)Топ-2017 г. (па версіі ej.by)Нацыянальны статыстычны камітэт Рэспублікі БеларусьШчыльнасць насельніцтва па краінахhttp://naviny.by/rubrics/society/2011/09/16/ic_articles_116_175144/А. Калечыц, У. Ксяндзоў. Спробы засялення краю неандэртальскім чалавекам.І ў Менску былі мамантыА. Калечыц, У. Ксяндзоў. Старажытны каменны век (палеаліт). Першапачатковае засяленне тэрыторыіГ. Штыхаў. Балты і славяне ў VI—VIII стст.М. Клімаў. Полацкае княства ў IX—XI стст.Г. Штыхаў, В. Ляўко. Палітычная гісторыя Полацкай зямліГ. Штыхаў. Дзяржаўны лад у землях-княствахГ. Штыхаў. Дзяржаўны лад у землях-княствахБеларускія землі ў складзе Вялікага Княства ЛітоўскагаЛюблінская унія 1569 г."The Early Stages of Independence"Zapomniane prawdy25 гадоў таму было аб'яўлена, што Язэп Пілсудскі — беларус (фота)Наша вадаДакументы ЧАЭС: Забруджванне тэрыторыі Беларусі « ЧАЭС Зона адчужэнняСведения о политических партиях, зарегистрированных в Республике Беларусь // Министерство юстиции Республики БеларусьСтатыстычны бюлетэнь „Полаўзроставая структура насельніцтва Рэспублікі Беларусь на 1 студзеня 2012 года і сярэднегадовая колькасць насельніцтва за 2011 год“Индекс человеческого развития Беларуси — не было бы нижеБеларусь занимает первое место в СНГ по индексу развития с учетом гендерного факцёраНацыянальны статыстычны камітэт Рэспублікі БеларусьКанстытуцыя РБ. Артыкул 17Трансфармацыйныя задачы БеларусіВыйсце з крызісу — далейшае рэфармаванне Беларускі рубель — сусветны лідар па дэвальвацыяхПра змену коштаў у кастрычніку 2011 г.Бядней за беларусаў у СНД толькі таджыкіСярэдні заробак у верасні дасягнуў 2,26 мільёна рублёўЭканомікаГаласуем за ТОП-100 беларускай прозыСучасныя беларускія мастакіАрхитектура Беларуси BELARUS.BYА. Каханоўскі. Культура Беларусі ўсярэдзіне XVII—XVIII ст.Анталогія беларускай народнай песні, гуказапісы спеваўБеларускія Музычныя IнструментыБеларускі рок, які мы страцілі. Топ-10 гуртоў«Мясцовы час» — нязгаслая легенда беларускай рок-музыкіСЯРГЕЙ БУДКІН. МЫ НЯ ЗНАЕМ СВАЁЙ МУЗЫКІМ. А. Каладзінскі. НАРОДНЫ ТЭАТРМагнацкія культурныя цэнтрыПублічная дыскусія «Беларуская новая пьеса: без беларускай мовы ці беларуская?»Беларускія драматургі па-ранейшаму лепш ставяцца за мяжой, чым на радзіме«Працэс незалежнага кіно пайшоў, і дзяржаву турбуе яго непадкантрольнасць»Беларускія філосафы ў пошуках прасторыВсе идём в библиотекуАрхіваванаАб Нацыянальнай праграме даследавання і выкарыстання касмічнай прасторы ў мірных мэтах на 2008—2012 гадыУ космас — разам.У суседнім з Барысаўскім раёне пабудуюць Камандна-вымяральны пунктСвяты і абрады беларусаў«Мірныя бульбашы з малой краіны» — 5 непраўдзівых стэрэатыпаў пра БеларусьМ. Раманюк. Беларускае народнае адзеннеУ Беларусі скарачаецца колькасць злачынстваўЛукашэнка незадаволены мінскімі ўладамі Крадзяжы складаюць у Мінску каля 70% злачынстваў Узровень злачыннасці ў Мінскай вобласці — адзін з самых высокіх у краіне Генпракуратура аналізуе стан са злачыннасцю ў Беларусі па каэфіцыенце злачыннасці У Беларусі стабілізавалася крымінагеннае становішча, лічыць генпракурорЗамежнікі сталі здзяйсняць у Беларусі больш злачынстваўМУС Беларусі турбуе рост рэцыдыўнай злачыннасціЯ з ЖЭСа. Дазволіце вас абкрасці! Рэйтынг усіх службаў і падраздзяленняў ГУУС Мінгарвыканкама вырасАб КДБ РБГісторыя Аператыўна-аналітычнага цэнтра РБГісторыя ДКФРТаможняagentura.ruБеларусьBelarus.by — Афіцыйны сайт Рэспублікі БеларусьСайт урада БеларусіRadzima.org — Збор архітэктурных помнікаў, гісторыя Беларусі«Глобус Беларуси»Гербы и флаги БеларусиАсаблівасці каменнага веку на БеларусіА. Калечыц, У. Ксяндзоў. Старажытны каменны век (палеаліт). Першапачатковае засяленне тэрыторыіУ. Ксяндзоў. Сярэдні каменны век (мезаліт). Засяленне краю плямёнамі паляўнічых, рыбакоў і збіральнікаўА. Калечыц, М. Чарняўскі. Плямёны на тэрыторыі Беларусі ў новым каменным веку (неаліце)А. Калечыц, У. Ксяндзоў, М. Чарняўскі. Гаспадарчыя заняткі ў каменным векуЭ. Зайкоўскі. Духоўная культура ў каменным векуАсаблівасці бронзавага веку на БеларусіФарміраванне супольнасцей ранняга перыяду бронзавага векуФотографии БеларусиРоля беларускіх зямель ва ўтварэнні і ўмацаванні ВКЛВ. Фадзеева. З гісторыі развіцця беларускай народнай вышыўкіDMOZGran catalanaБольшая российскаяBritannica (анлайн)Швейцарскі гістарычны15325917611952699xDA123282154079143-90000 0001 2171 2080n9112870100577502ge128882171858027501086026362074122714179пппппп

          ValueError: Expected n_neighbors <= n_samples, but n_samples = 1, n_neighbors = 6 (SMOTE) The 2019 Stack Overflow Developer Survey Results Are InCan SMOTE be applied over sequence of words (sentences)?ValueError when doing validation with random forestsSMOTE and multi class oversamplingLogic behind SMOTE-NC?ValueError: Error when checking target: expected dense_1 to have shape (7,) but got array with shape (1,)SmoteBoost: Should SMOTE be ran individually for each iteration/tree in the boosting?solving multi-class imbalance classification using smote and OSSUsing SMOTE for Synthetic Data generation to improve performance on unbalanced dataproblem of entry format for a simple model in KerasSVM SMOTE fit_resample() function runs forever with no result